Kościół św. Józefa został konsekrowany 15 września 1896 r. na miejscu pierwszego kościoła katolickiego w Mikołajowie, zbudowanego w 1794 r. Kościół na planie krzyża został zbudowany w stylu eklektycznym, z czerwonej cegły, z dwiema wieżami o wysokości 49 metrów. Przy świątyni działała szkoła parafialna i sierociniec dla ubogich dzieci. Po rewolucji świątynia została zamknięta, aw 1936 roku przeniesiona do
muzeum historii lokalnej.
Nabożeństwa w kościele zostały wznowione w 1992 roku z pomocą polskich księży katolickich. Odbudowa kościoła trwała ponad 10 lat. Odrestaurowano wnętrze kościoła, we wnętrzu pojawiły się nowe piękne rzeźby, odrestaurowano także stare drzwi kościoła. W 2008 roku zainstalowano tu nowe organy, podarowane przez katolików niemieckiego miasta Bochum.