Wiszący Kościół jest jednym z najstarszych kościołów w Egipcie. Za datę budowy uważa się III wiek naszej ery, a swoją nazwę zawdzięcza ciekawej lokalizacji: stoi w bramie babilońskiej twierdzy, jakby „wisi” między wieżami. Z kościołem wiąże się legenda, że ​​przebywali w nim rodzice Chrystusa, uciekając przed królem Herodem. Kościół ten nie ma kopuł, drewniany strop przypomina Arkę Noego, a posadzkę tworzą pnie palm, które kładzie się bezpośrednio na murach twierdzy.

Podobnie jak większość kościołów w Kairze, Wiszący Kościół przeszedł szereg procesów renowacji. Za pierwotną uważa się jedynie część znajdującą się na prawo od prezbiterium, nad bastionem południowym. Mimo to jest to jeden z najbardziej imponujących kościołów w mieście, słynący z marmurowej ambony, intarsjowanych ekranów i obrazów. W baptysterium po prawej stronie wycięto jeden z paneli podłogowych, aby zwiedzający mogli zobaczyć znajdującą się poniżej Bramę Wodną. Wyraźnie widać stąd jedną z bliźniaczych wież stojących na bramie.